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心脏灌流水蛋白质组学分析

检测项目

蛋白质鉴定类:

  • 肽段覆盖率:≥98%(参照ISO17025)
  • 蛋白质匹配数:≥2独特肽段/蛋白
  • 数据库搜索分数:>30置信度阈值
蛋白质定量类:
  • 绝对定量精度:CV<10%
  • 相对定量倍数变化:FC≥1.5显著性
  • 丰度线性范围:0.1-1000fmol/μL
翻译后修饰分析类:
  • 磷酸化位点检测:位点置信度>95%
  • 糖基化水平:丰度阈值0.01%
  • 乙酰化修饰定量:误差率<5%
生物标记物筛选类:
  • 差异表达蛋白筛选:p<0.05统计显著性
  • ROC曲线分析:AUC>0.8判别力
  • 生物通路富集:KEGG通路p值<0.01
质谱数据质量控制类:
  • MS/MS谱匹配率:>90%合格率
  • 峰面积重复性:RSD<5%
  • 系统稳定性测试:每日校准偏差<2%
样本预处理类:
  • 蛋白质提取效率:≥90%回收率
  • 酶解消化时间:37℃±1℃恒温
  • 除盐纯化效率:盐离子残留<10ppm
功能分析类:
  • 蛋白质互作网络:PPI置信度>0.7
  • GO注释分析:分子功能覆盖率≥80%
  • 亚细胞定位预测:准确率>85%
数据验证类:
  • Westernblot相关性:r>0.9一致性
  • ELISA定量验证:偏差<15%
  • 重复样本一致性:ICC>0.8
通路分析类:
  • KEGG富集分析:通路p值<0.05
  • Reactome通路映射:覆盖率≥70%
  • 代谢通路量化:变化倍数≥1.2
质量控制类:
  • 空白对照检测:背景信号<5%
  • 内标回收率:95-105%范围
  • 样本存储稳定性:-80℃保存期≥6月

检测范围

1.心脏灌流水样本:检测炎症因子和心肌损伤标志物,重点分析肌钙蛋白和BNP水平变化。

2.心肌组织匀浆:细胞骨架蛋白和收缩蛋白定量,侧重缺血再灌注损伤相关蛋白。

3.血浆样品:心血管疾病生物标记物筛查,检测重点为凝血因子和脂蛋白谱。

4.血清样品:炎症因子和细胞因子分析,核心检测C反应蛋白和白介素水平。

5.细胞培养上清:心肌细胞分泌蛋白组,关注生长因子和凋亡相关蛋白表达。

6.病理组织样本:心肌梗死病变标志物鉴定,重点检测纤维化蛋白和坏死区域蛋白。

7.动物模型灌流液:药物干预效果评估,检测氧化应激蛋白和代谢酶变化。

8.临床试验样本:患者组蛋白谱横向比较,侧重心脏衰竭相关差异蛋白。

9.新鲜冷冻心脏组织:全蛋白质组分析,检测重点为膜蛋白和离子通道蛋白。

10.存档福尔马林固定样本:优化提取方法进行回顾研究,核心检测组蛋白修饰和抗原修复效率。

检测方法

国际标准:

  • ISO17025:2017实验室能力通用要求
  • ISO15189:2022医学实验室质量和能力要求
  • HUPO-PSI标准蛋白质组学数据格式规范
国家标准:
  • GB/T27407-2010实验室质量控制规范
  • GB/T37864-2019生物样本库质量管理
  • GB/T3358.1-2009数据处理标准
方法差异说明:ISO标准侧重全面质量体系,GB标准更注重特定参数控制;例如,蛋白质定量中ISO要求系统验证覆盖全动态范围,GB标准则限定线性校准点数量。

检测设备

1.高效液相色谱仪:Agilent1290InfinityII(流速范围0.1-5mL/min)

2.串联质谱仪:ThermoFisherQExactiveHF-X(分辨率120,000)

3.离心机:Eppendorf5427R(最大转速15,000rpm)

4.电泳系统:Bio-RadMini-PROTEANTetraCell(电压范围50-500V)

5.酶标仪:PerkinElmerEnVision(检测波长200-1000nm)

6.超声波破碎仪:SonicsVCX750(功率750W)

7.冷冻干燥机:LabconcoFreeZone(温度-50℃)

8.pH计:MettlerToledoSevenCompact(精度±0.01)

9.纳米滴仪:ThermoScientificNanoDropOne(样品体积1μL)

10.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(片段大小10-15000bp)

11.真空浓缩仪:EppendorfVacufugePlus(真空度<5mbar)

12.恒温混匀仪:ThermoScientificMixMate(转速100-1500rpm)

13.超纯水系统:Milli-QAdvantageA10(电阻率18.2MΩ·cm)

14.数据服务器:DellPowerEdgeR740(存储容量100TB)

15.恒温培养箱:MemmertIN110(温度范围4-60℃)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

心脏灌流水蛋白质组学分析
其他检测

中析研究所可进行各种检测分析服务,包括不限于:标准试验,非标检测,分析测试,认证设计,产品验收,质量内控,矢量分析,内部控制,司法鉴定等。可出具合法合规、具有公信力的第三方检测报告。