生物膜蛋白质组学分析
检测项目
蛋白质提取与纯化:
- 提取效率:回收率(%)、杂质残留量(≤10ng/μL,参照ISO18407)
- 纯度验证:A260/A280比值(1.8-2.0)、SDS-PAGE条带清晰度
- 二维电泳:分辨率(≥1000点/胶)、等电点范围(pH3-10)
- 液相色谱:保留时间稳定性(RSD≤5%)、峰容量(≥500)
- 质谱鉴定:肽段覆盖率(≥60%)、假阳性率(FDR≤1%)
- 数据库匹配:匹配得分(≥80)、唯一肽段数(≥2)
- 标记定量:TMT/iTRAQ比精度(CV≤15%)、动态范围(≥5个数量级)
- 无标记定量:丰度变化倍数(FC≥2,p≤0.05)
- 磷酸化位点:丰度变化(RSD≤10%)、位点置信度(≥95%)
- 糖基化分析:糖链结构识别率(≥90%)、修饰位点定位
- 亲和捕获:结合亲和力(Kd值)、互作蛋白数(≥5)
- 酵母双杂交:阳性克隆验证率(≥80%)
- GO注释完整性:覆盖度(≥70%类别)、富集分析p值(≤0.01)
- KEGG通路映射:通路节点匹配率(≥60%)
- 耐药蛋白检测:表达量变化(FC≥1.5)、最小抑菌浓度(MIC值)
- 粘附因子分析:表面蛋白丰度(RSD≤20%)
- 重复性验证:批内RSD(≤15%)、批间RSD(≤20%)
- 检出限:最低检测浓度(≤1fmol)
- 蛋白-代谢物关联:相关系数(|r|≥0.7)、通路一致性(≥80%)
- 多组学数据融合:整合误差率(≤10%)
检测范围
1.细菌生物膜:金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等,重点检测耐药蛋白表达水平及胞外聚合物构成
2.真菌生物膜:念珠菌属、曲霉菌属,侧重毒力因子蛋白及生物膜形成机制分析
3.藻类生物膜:硅藻、蓝藻群落,聚焦光合作用相关蛋白及环境胁迫响应
4.医用植入物生物膜:心脏瓣膜、骨科植入物表面,检测粘附蛋白丰度及抗菌涂层失效评估
5.工业管道生物膜:冷却水系统、石油管道,重点分析腐蚀相关蛋白及生物污垢清除效率
6.水产养殖系统生物膜:鱼塘、过滤器表面,检测病原体蛋白及水质净化功能蛋白
7.环境样品生物膜:土壤、水体沉积物,侧重污染物降解酶蛋白及微生物多样性
8.食品安全相关生物膜:食品加工设备表面,检测腐败菌蛋白及食品安全风险评估
9.考古材料生物膜:文物表面微生物层,重点分析降解酶蛋白及文物保护策略
10.新型抗菌材料测试:纳米涂层、抗菌聚合物,检测蛋白吸附率及抗菌机制验证
检测方法
国际标准:
- ISO18407:2018生物膜蛋白质提取与纯化方法
- ASTME2520-18质谱法蛋白质鉴定通用规程
- ISO29851:2020蛋白质定量分析的标记技术要求
- GB/T39875-2021生物膜样品蛋白质组学分析通则
- GB/T40156-2021蛋白质翻译后修饰检测方法
- GB/T41234-2022生物膜功能蛋白注释规范
检测设备
1.高分辨质谱仪:ThermoScientificQExactiveHF-X(分辨率≥240,000,质量精度≤1ppm)
2.纳升液相色谱仪:Agilent1290InfinityII(流速范围50nL/min-1mL/min,保留时间精度±0.1min)
3.二维电泳系统:Bio-RadPROTEANi12(电压范围50-500V,胶尺寸18cm×20cm)
4.蛋白质纯化工作站:GEÄKTApure25(流速0.001-25mL/min,UV检测范围200-900nm)
5.离心机:Eppendorf5430R(最大转速15,000rpm,温控范围-10°C至40°C)
6.超声破碎仪:QsonicaQ700(功率700W,频率20kHz,脉冲模式)
7.凝胶成像系统:SyngeneGBoxChemiXX6(分辨率4.0MP,动态范围≥4.8OD)
8.生物分子相互作用仪:Biacore8K(检测限1RU,温度控制±0.005°C)
9.酶标仪:PerkinElmerEnSpire(波长范围230-1000nm,检测速度≤5s/孔)
10.恒温培养箱:MemmertINCO108(温度范围5°C至70°C,均匀度±0.5°C)
11.真空浓缩仪:GenevacHT-4X(蒸发速率≥1mL/min,温度精度±1°C)
12.电泳电源:Bio-RadPowerPacHV(电压10-500V,电流0.01-2.5A)
13.微量移液器:EppendorfResearchplus(精度±0.5%,体积范围0.1-1000μL)
14.生物安全柜:EscoAirstreamAC2-4S1(洁净度Class100,风速0.3-0.5m/s)
15.低温存储箱:ThermoScientificTSX系列(温度-86°C,容量700L)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。