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氧化菌功能基因检测

检测项目

硝化功能基因检测:

  • amoA基因检测:[拷贝数≥10^4copies/gsoil]、[多样性指数≥0.8](参照ISO11731)
  • nxrB基因检测:[表达水平≥5-foldchange]、[变异频率≤1%]
反硝化功能基因检测:
  • narG基因检测:[丰度≥50copies/μL]、[转录活性≥80%]
  • nirK基因检测:[序列相似度≥95%]、[功能潜力≥0.9]
甲烷氧化功能基因检测:
  • pmoA基因检测:[拷贝数≥10^3copies/mL]、[群落结构复杂性≥10OTUs]
  • mmoX基因检测:[表达量≥2.5log]、[催化效率≥0.5U/mg]
硫氧化功能基因检测:
  • soxB基因检测:[丰度≥100copies/g]、[多样性≥0.7Shannon]
  • dsrA基因检测:[表达水平≥3-fold]、[系统发育距离≤0.01]
铁氧化功能基因检测:
  • cycA基因检测:[拷贝数≥500copies/mL]、[功能验证率≥90%]
  • mtoA基因检测:[变异率≤0.5%]、[热稳定性≥60°C]
芳香烃氧化功能基因检测:
  • nahA基因检测:[丰度≥200copies/g]、[代谢速率≥0.1mg/h]
  • todC1基因检测:[序列多样性≥15haplotypes]、[表达调控因子≥2.0]
氨氧化功能基因检测:
  • amoB基因检测:[拷贝数≥10^4copies/g]、[群落丰度≥10^5CFU]
  • hao基因检测:[转录水平≥4-fold]、[酶活性≥0.3U/mL]
一氧化碳氧化功能基因检测:
  • coxL基因检测:[丰度≥50copies/μL]、[多样性≥0.6]
  • coxM基因检测:[表达量≥2.0log]、[功能评估分数≥85%]
氢氧化功能基因检测:
  • hhyL基因检测:[拷贝数≥300copies/mL]、[系统发育深度≥5clades]
  • hydA基因检测:[变异频率≤0.3%]、[催化能力≥0.4mmol/g]
多环芳烃氧化功能基因检测:
  • phnA基因检测:[丰度≥150copies/g]、[降解效率≥70%]
  • bphA基因检测:[表达水平≥3.5-fold]、[群落动态稳定性≥0.8]

检测范围

1.环境土壤样本:涵盖农田及林地土壤,重点检测硝化细菌amoA基因丰度与多样性指数变化

2.淡水生态系统样本:包括河流及湖泊水体,侧重反硝化基因narG表达水平和群落结构分析

3.废水处理厂活性污泥:涉及工业及市政废水,聚焦甲烷氧化基因pmoA拷贝数和功能活性评估

4.海洋沉积物样本:覆盖近海及深海区域,重点检测硫氧化基因soxB丰度与系统发育多样性

5.生物膜附着样本:源自管道及岩石表面,侧重铁氧化基因cycA表达调控和热稳定性参数

6.废弃物堆肥材料:包括有机废弃物发酵产物,关注一氧化碳氧化基因coxL变异频率和功能潜力

7.农业耕种土壤样本:涉及水稻田及旱地,重点评估氨氧化基因amoB转录水平与酶活性关联

8.工业污染水体样本:涵盖化工废水及排污口,侧重芳香烃氧化基因nahA代谢速率和序列多样性

9.湿地沉积物样本:包括沼泽及红树林区域,聚焦氢氧化基因hhyL拷贝数与催化能力分析

10.空气颗粒物捕获样本:源于大气沉降物,重点检测多环芳烃氧化基因phnA降解效率和群落动态

检测方法

国际标准:

  • ISO11731:2017水质样品微生物基因定量PCR方法
  • ASTMD7450-19环境样品功能基因多样性高通量测序规程
  • JISK0550:2020微生物氧化基因表达水平检测技术
国家标准:
  • GB/T20240-2021环境微生物功能基因拷贝数检测规范
  • HJ912-2020水体氧化菌基因多样性分析方法
  • GB/Z30123-2013土壤样品功能基因表达量测定指南
国际标准如ISO11731侧重SYBRGreenqPCR定量,ASTMD7450强调Illumina测序流程;国家标准GB/T20240采用TaqMan探针提高特异性,HJ912整合本土化样本预处理差异

检测设备

1.实时荧光定量PCR仪:AppliedBiosystems7500型(检测范围20-10^9拷贝/μL,精度±0.5%)

2.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Tb/run,读长2x150bp)

3.梯度PCR扩增仪:Bio-RadT100ThermalCycler(温度梯度范围30-100°C,精度±0.1°C)

4.凝胶成像分析系统:Tanon3500(分辨率5M像素,检测限0.1ngDNA)

5.核酸自动提取仪:QIAGENQiacube(处理量24样本/批次,回收率≥95%)

6.超微量分光光度计:NanoDropOne(波长范围190-1100nm,检测下限2ng/μL)

7.恒温混匀振荡仪:EppendorfThermoMixerC(转速100-1400rpm,温度范围-10-100°C)

8.电泳分离系统:BIO-RADPowerPacBasic(电压10-300V,电流0-400mA)

9.高速冷冻离心机:ThermoScientificSorvallST16(最大转速16000rpm,温度控制-10-40°C)

10.恒温培养箱:MemmertINCOmed(温度范围5-60°C,湿度控制±2%)

11.紫外可见分光光度计:ShimadzuUV-1800(波长精度±0.5nm,带宽1nm)

12.生物安全操作柜:EscoA2型(风速0.5m/s,HEPA过滤效率99.99%)

13.超低温存储冰箱:ThermoScientificForma(温度-86°C,稳定性±2°C)

14.振荡培养摇床:InforsHTMultitron(振幅25-50mm,转速50-300rpm)

15.精密自动移液器:EppendorfResearchplus(量程0.1-1000μL,精度±0.5%)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

氧化菌功能基因检测
其他检测

中析研究所可进行各种检测分析服务,包括不限于:标准试验,非标检测,分析测试,认证设计,产品验收,质量内控,矢量分析,内部控制,司法鉴定等。可出具合法合规、具有公信力的第三方检测报告。