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生物膜蛋白质组学分析

检测项目

蛋白质提取与纯化:

  • 提取效率:回收率(%)、杂质残留量(≤10ng/μL,参照ISO18407)
  • 纯度验证:A260/A280比值(1.8-2.0)、SDS-PAGE条带清晰度
蛋白质分离技术:
  • 二维电泳:分辨率(≥1000点/胶)、等电点范围(pH3-10)
  • 液相色谱:保留时间稳定性(RSD≤5%)、峰容量(≥500)
蛋白质鉴定分析:
  • 质谱鉴定:肽段覆盖率(≥60%)、假阳性率(FDR≤1%)
  • 数据库匹配:匹配得分(≥80)、唯一肽段数(≥2)
定量蛋白质组学:
  • 标记定量:TMT/iTRAQ比精度(CV≤15%)、动态范围(≥5个数量级)
  • 无标记定量:丰度变化倍数(FC≥2,p≤0.05)
翻译后修饰检测:
  • 磷酸化位点:丰度变化(RSD≤10%)、位点置信度(≥95%)
  • 糖基化分析:糖链结构识别率(≥90%)、修饰位点定位
蛋白质相互作用:
  • 亲和捕获:结合亲和力(Kd值)、互作蛋白数(≥5)
  • 酵母双杂交:阳性克隆验证率(≥80%)
功能注释与通路:
  • GO注释完整性:覆盖度(≥70%类别)、富集分析p值(≤0.01)
  • KEGG通路映射:通路节点匹配率(≥60%)
生物膜特性关联:
  • 耐药蛋白检测:表达量变化(FC≥1.5)、最小抑菌浓度(MIC值)
  • 粘附因子分析:表面蛋白丰度(RSD≤20%)
质量控制指标:
  • 重复性验证:批内RSD(≤15%)、批间RSD(≤20%)
  • 检出限:最低检测浓度(≤1fmol)
代谢组学整合:
  • 蛋白-代谢物关联:相关系数(|r|≥0.7)、通路一致性(≥80%)
  • 多组学数据融合:整合误差率(≤10%)

检测范围

1.细菌生物膜:金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等,重点检测耐药蛋白表达水平及胞外聚合物构成

2.真菌生物膜:念珠菌属、曲霉菌属,侧重毒力因子蛋白及生物膜形成机制分析

3.藻类生物膜:硅藻、蓝藻群落,聚焦光合作用相关蛋白及环境胁迫响应

4.医用植入物生物膜:心脏瓣膜、骨科植入物表面,检测粘附蛋白丰度及抗菌涂层失效评估

5.工业管道生物膜:冷却水系统、石油管道,重点分析腐蚀相关蛋白及生物污垢清除效率

6.水产养殖系统生物膜:鱼塘、过滤器表面,检测病原体蛋白及水质净化功能蛋白

7.环境样品生物膜:土壤、水体沉积物,侧重污染物降解酶蛋白及微生物多样性

8.食品安全相关生物膜:食品加工设备表面,检测腐败菌蛋白及食品安全风险评估

9.考古材料生物膜:文物表面微生物层,重点分析降解酶蛋白及文物保护策略

10.新型抗菌材料测试:纳米涂层、抗菌聚合物,检测蛋白吸附率及抗菌机制验证

检测方法

国际标准:

  • ISO18407:2018生物膜蛋白质提取与纯化方法
  • ASTME2520-18质谱法蛋白质鉴定通用规程
  • ISO29851:2020蛋白质定量分析的标记技术要求
国家标准:
  • GB/T39875-2021生物膜样品蛋白质组学分析通则
  • GB/T40156-2021蛋白质翻译后修饰检测方法
  • GB/T41234-2022生物膜功能蛋白注释规范
(方法差异说明:国际标准ISO18407强调室温提取条件,而GB/T39875允许低温优化;ASTME2520要求高分辨质谱,GB/T版本兼容中低端设备;定量分析中ISO29851定义严格标记比例,GB标准增加无标记方法选项)

检测设备

1.高分辨质谱仪:ThermoScientificQExactiveHF-X(分辨率≥240,000,质量精度≤1ppm)

2.纳升液相色谱仪:Agilent1290InfinityII(流速范围50nL/min-1mL/min,保留时间精度±0.1min)

3.二维电泳系统:Bio-RadPROTEANi12(电压范围50-500V,胶尺寸18cm×20cm)

4.蛋白质纯化工作站:GEÄKTApure25(流速0.001-25mL/min,UV检测范围200-900nm)

5.离心机:Eppendorf5430R(最大转速15,000rpm,温控范围-10°C至40°C)

6.超声破碎仪:QsonicaQ700(功率700W,频率20kHz,脉冲模式)

7.凝胶成像系统:SyngeneGBoxChemiXX6(分辨率4.0MP,动态范围≥4.8OD)

8.生物分子相互作用仪:Biacore8K(检测限1RU,温度控制±0.005°C)

9.酶标仪:PerkinElmerEnSpire(波长范围230-1000nm,检测速度≤5s/孔)

10.恒温培养箱:MemmertINCO108(温度范围5°C至70°C,均匀度±0.5°C)

11.真空浓缩仪:GenevacHT-4X(蒸发速率≥1mL/min,温度精度±1°C)

12.电泳电源:Bio-RadPowerPacHV(电压10-500V,电流0.01-2.5A)

13.微量移液器:EppendorfResearchplus(精度±0.5%,体积范围0.1-1000μL)

14.生物安全柜:EscoAirstreamAC2-4S1(洁净度Class100,风速0.3-0.5m/s)

15.低温存储箱:ThermoScientificTSX系列(温度-86°C,容量700L)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

生物膜蛋白质组学分析
其他检测

中析研究所可进行各种检测分析服务,包括不限于:标准试验,非标检测,分析测试,认证设计,产品验收,质量内控,矢量分析,内部控制,司法鉴定等。可出具合法合规、具有公信力的第三方检测报告。