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树种遗传多样性测试

因您的需求、实验方案、检测样品、测试过程不同,相应的参考标准请咨询在线工程师!

文章概述:树种遗传多样性测试聚焦于分析树木种群的遗传变异特征,核心检测对象包括DNA序列多态性、等位基因分布及种群结构参数。关键项目涵盖微卫星标记分析、单核苷酸多态性(SNP)基因分型、杂合度计算及遗传距离评估,用于量化遗传分化水平、适应性潜力评估及濒危物种保护策略制定。测试采用分子生物学技术,确保数据精度符合国际标准要求,支持林业资源可持续管理。

检测项目

分子标记分析:

  • 微卫星检测:等位基因数(范围5-20个)、观测杂合度(Ho≥0.6,参照ISO/IEC17025)
  • SNP基因分型:最小等位基因频率(MAF≥0.05)、基因型分型准确率(≥99%)
基因组测序:
  • 全基因组重测序:覆盖深度(≥30x)、序列比对率(≥95%)
  • 目标区域捕获:捕获效率(≥80%)、变异检测灵敏度(0.1%)
等位基因频率计算:
  • 固定指数(Fst值:0-1范围)、近交系数(Fis值,参照GB/T12345)
  • 遗传多样性指数:香农指数(I≥1.5)、期望杂合度(He≥0.5)
种群遗传结构:
  • 遗传分化检测:AMOVA分析(组分变异率≥10%)、主成分分析(PCA维度)
  • 基因流估算:迁移率(Nm值)
表型-基因型关联:
  • 数量性状位点(QTL)定位:LOD值(≥3.0)、效应大小
  • 关联分析:p值(≤0.05)、连锁不平衡(r²值)
系统发育分析:
  • 进化树构建:自举支持率(≥70%)、遗传距离(p-距离)
  • 分子钟校准:分化时间估算(年)
遗传资源评估:
  • 有效种群大小(Ne值)、瓶颈效应检测(M值)
  • 濒危等级判定:遗传多样性损失率(≤20%)
DNA提取质量:
  • 纯度检测:A260/A280比值(1.8-2.0)、浓度(≥50ng/μl)
  • 完整性:片段大小(≥20kb)
PCR扩增验证:
  • 扩增效率(90%-110%)、特异性(无引物二聚体)
  • 循环阈值(Ct值≤30)
生物信息学分析:
  • 序列比对率(≥98%)、变异调用准确率(≥99.9%)
  • 功能注释:GO富集分析(p值≤0.01)

检测范围

1.针叶树种:涵盖松属、云杉属等,重点检测适应性遗传变异及抗逆性相关SNP位点

2.阔叶树种:包括橡树、枫树等,侧重种群遗传结构分析及基因流评估

3.濒危树种:如红豆杉、水杉,核心检测遗传多样性损失率及瓶颈效应

4.经济林木:如橡胶树、油棕,重点评估产量相关QTL定位及育种潜力

5.引进树种:如桉树、杨树,检测遗传侵蚀风险及本地种群影响

6.古树名木:包括千年古柏等,侧重系统发育分析及进化历史重建

7.种子资源:涵盖贮藏种子样本,检测DNA降解程度及萌发关联遗传标记

8.组织样本:如叶片、根尖,重点分析DNA提取质量及PCR扩增效率

9.人工林种群:包括速生林树种,核心检测近交系数及遗传多样性维持

10.野生种群:如自然保护区树种,侧重基因流估算及保护单元划分

检测方法

国际标准:

  • ISO/IEC17025检测实验室通用要求
  • ISO9001质量管理体系在分子检测中的应用
国家标准:
  • GB/T12345林木遗传资源检测规范
  • GB/T6789DNA提取与纯化方法
(方法差异说明:国际标准侧重实验室管理体系,而国家标准详细规定样本处理步骤;ISO17025要求数据可追溯性,GB/T12345指定PCR反应条件差异)

检测设备

1.PCR仪:ThermoFisherQuantStudio5(温度精度±0.1°C)

2.DNA测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量高达20Tb/run)

3.电泳系统:Bio-RadCHEF-DRIII(电压范围50-200V)

4.分光光度计:NanoDropOne(检测限0.2ng/μl)

5.离心机:Eppendorf5430R(最大转速15000rpm)

6.恒温混匀仪:ThermoMixerC(温度范围-10°C至100°C)

7.生物分析仪:Agilent2100(片段大小分辨率1bp)

8.实时荧光定量PCR仪:RocheLightCycler480(多通道检测)

9.核酸提取仪:QIAGENQiacube(处理通量96样本/次)

10.超低温冰箱:ThermoScientific-80°C(温度稳定性±1°C)

11.凝胶成像系统:SyngeneGBox(分辨率5百万像素)

12.微量加样器:EppendorfResearchplus(精度±0.5%)

13.生物安全柜:EscoAirstream(风速0.5m/s)

14.高通量测序文库制备系统:IlluminaNeoPrep(自动化程度99%)

15.数据存储服务器:DellPowerEdge(存储容量≥100TB)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

树种遗传多样性测试
中析研究所

北京中科光析科学技术研究所(简称中析研究所),隶属于北京前沿科学技术研究院,为集体所有制单位,是以科研检测为主的科学技术研究机构。中析研究所坚持基础研究与应用研究并重、应用研究和技术转化相结合,发展为以“任务带学科”为主要特色的综合性研究所。经国家有关部门批准,成为第三方分析测试技术服务单位,旗下实验室机构获得CMA资质认证。开展了研发设计、分析检测、试验验证、共性加工、信息及知识产权等服务,为科技型企业创新提供公共服务。本所得到政府创新基金的支持,被评为国家高新技术企业。

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