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表达序列标签检测

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文章概述:检测项目1.序列完整性分析:评估cDNA文库质量,要求5'端完整度≥95%,3'端polyA尾长度≥20bp2.特异性验证:通过BLAST比对确认同源序列匹配度≥98%,E值≤1e-503.重复性测试:三次独立实验的Reads覆盖一致性≥99.5%4.表达丰度定量:采用RPKM标准化方法,相对误差≤5%5.SNP识别精度:二代测序数据Phred质量值≥Q30,变异检出限0.1%检测范围1.真核生物cDNA文库(哺乳动物/植物/真菌)2.基因芯片探针序列3.RNA-Seq建库产物4.分子标记开发中间体5

检测项目

1.序列完整性分析:评估cDNA文库质量,要求5'端完整度≥95%,3'端polyA尾长度≥20bp2.特异性验证:通过BLAST比对确认同源序列匹配度≥98%,E值≤1e-503.重复性测试:三次独立实验的Reads覆盖一致性≥99.5%4.表达丰度定量:采用RPKM标准化方法,相对误差≤5%5.SNP识别精度:二代测序数据Phred质量值≥Q30,变异检出限0.1%

检测范围

1.真核生物cDNA文库(哺乳动物/植物/真菌)2.基因芯片探针序列3.RNA-Seq建库产物4.分子标记开发中间体5.合成生物学元件(启动子/终止子)

检测方法

1.ISO20395:2019生物技术-核酸定量方法学验证规范2.ASTME3006-15下一代测序数据质量评估标准3.GB/T30988-2014多聚腺苷酸尾长度测定方法4.ISO/IECDIS23126生物信息学数据比对验证指南5.GB/T34797-2017核酸测序试剂盒通用技术要求

检测设备

1.Agilent2100Bioanalyzer:核酸完整性指数(RIN)测定2.IlluminaNovaSeq6000:高通量双端测序(2150bp)3.ThermoFisherQubit4.0:荧光法定量dsDNA/RNA4.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化建库工作站5.RocheLightCycler480II:实时定量PCR验证6.OxfordNanoporeGridION:长读长序列校正7.CovarisM220:超声片段化控制系统8.EppendorfMastercyclerX50:梯度PCR扩增仪9.PerkinElmerLabChipGXTouch:微流控芯片分析系统10.Bio-RadCFXOpus96:多重荧光定量分析

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

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中析研究所

北京中科光析科学技术研究所(简称中析研究所),隶属于北京前沿科学技术研究院,为集体所有制单位,是以科研检测为主的科学技术研究机构。中析研究所坚持基础研究与应用研究并重、应用研究和技术转化相结合,发展为以“任务带学科”为主要特色的综合性研究所。经国家有关部门批准,成为第三方分析测试技术服务单位,旗下实验室机构获得CMA资质认证。开展了研发设计、分析检测、试验验证、共性加工、信息及知识产权等服务,为科技型企业创新提供公共服务。本所得到政府创新基金的支持,被评为国家高新技术企业。

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