检测项目

基因序列分析：

• 全基因组测序：覆盖度（≥30x）、读取长度（2x150bp，参照ISO20395:2019）
• 目标区域捕获测序：捕获效率（>95%）、特异性（≥99.5%）
• 突变位点鉴定：检出限（变异频率0.1%）、假阳性率（<0.05%）

• SNP调用精度：准确率（>99.9%，参照GB/T30988-2014）
• 等位基因频率计算：AF范围（0-1）、置信区间（95%CI）
• 杂合性检测：杂合率（HT≥0.01）、平衡性偏差（|Fst|≤0.05）

• 突变发生率量化：突变率（每Mb≥5）、频率分布（泊松模型拟合）
• 群体遗传分析：固定指数（Fst≥0.1）、基因流检测（Nm值）
• 显著性评估：p值（<0.05）、效应大小（Cohen'sd）

• Sanger测序验证：一致性（>99%）、错误校正率
• 数字PCR定量：变异频率精度（±0.05%）、检测限（0.01%）
• CRISPR编辑验证：编辑效率（≥80%）、脱靶率（<1%）

• 序列比对：比对率（≥95%）、插入缺失检测
• 变异注释：功能影响评分（如SIFT≤0.05）、保守性分析
• 质量控制：Q30分数（≥80%）、重复一致性（κ系数>0.9）

• qRT-PCR验证：表达量相关性（r≥0.8）、阈值循环数（Ct值）
• RNA测序分析：差异表达倍数（logFC≥2）、FDR校正（<0.05）
• 共表达网络：模块显著性（p<0.01）、连通度（≥10）

• 表型评分关联：相关系数（|r|≥0.5）、回归斜率
• 胁迫响应检测：生存率（≥70%）、水分利用效率（WUE偏差）
• 遗传力估算：广义遗传力（H²≥0.3）、遗传增益

• DNA完整性：片段大小（≥200bp）、降解率（<10%）
• 样本均一性：批次效应控制（R²≤0.1）、重复间变异（CV<5%）
• 数据存储：原始数据保留（FASTQ格式）、备份完整性

• 生长条件调控：温度偏差（±2°C）、光照强度（≥1000μmol/m²/s）
• 水分胁迫模拟：干旱梯度（0-50%FC）、时间点采样
• 协变量分析：混杂因素去除（PCA载荷）

• 突变频率报告：突变热点（≥5%频率）、累积分布
• 统计摘要：均值±SD、置信区间
• 可视化输出：曼哈顿图、频率直方图分辨率

检测范围

1.玉米杂交种：涵盖抗旱基因型如ZmDREB2A，重点检测SNP突变频率与产量性状关联

2.水稻幼苗：针对OsNAC基因家族，侧重干旱胁迫下突变累计算和表达变化

3.小麦种子：包括硬粒小麦品种，检测TaLEA-3等基因突变对发芽率影响

4.大豆根组织：涉及GmPYL基因，重点分析突变频率与根系构型相关性

5.棉花纤维样本：覆盖GhABF基因，检测突变在水分效率中的角色验证

6.高粱茎秆：针对SbERJianCeA基因，侧重突变累积速率和抗逆性评估

7.转基因作物：如过表达抗旱基因植株，检测编辑效率突变稳定性

8.野生近缘种：包括耐旱野生稻，重点分析稀有突变频率和进化适应性

9.林木叶片：如杨树PtP5CS基因，检测长期干旱下突变频率动态

10.园艺作物果实：番茄SlAREB基因，侧重突变与果实品质抗旱关联

检测方法

国际标准：

• ISO20395:2019生物技术-高通量测序质量控制（覆盖度要求≥25x）
• ISO/IEC17025:2017检测实验室通用要求（数据完整性控制）
• ISO5725-2:2019准确度与精密度评估（重复性限r≤0.1%）
• ISO10993-3:2014遗传毒性测试（突变风险阈值设定与国际差异如样本处理）

• GB/T30988-2014植物抗旱性检测方法（突变频率计算AF≥0.01）
• GB/T19495-2004转基因植物及其产品检测（编辑位点验证精度）
• GB/T3543-1995农作物种子检验（发芽率协变量分析）
• GB/T28627-2012分子生物学检测通用要求（数据存储格式差异如FASTAvs.FASTQ）

检测设备

1.高通量测序仪：IlluminaNovaSeq6000（通量最高6Tb，读长2x150bp）

2.实时PCR系统：AppliedBiosystems7500Fast（检测通道6个，灵敏度5拷贝/μL）

3.数字PCR仪：Bio-RadQX200（分区数20,000，精度±0.1%）

4.电泳系统：Agilent4200TapeStation（片段分析范围100-5000bp，分辨率1bp）

5.离心机：Eppendorf5424R（转速15,000rpm，控温范围-10-40°C）

6.核酸定量仪：ThermoNanoDropOne（波长260/280nm，精度±0.1OD）

7.生物分析仪：Agilent2100Bioanalyzer（RNA完整性数RIN≥8）

8.恒温培养箱：MemmertIN110（温度范围0-70°C，稳定性±0.5°C）

9.光照生长箱：ConvironPGR15（光照强度0-1500μmol/m²/s，湿度控制）

10.样本破碎仪：FastPrep-24（破碎效率>95%，速度6.5m/s）

11.真空浓缩仪：EppendorfConcentratorPlus（蒸发速率1mL/min，温度控制）

12.低温存储柜：ThermoForma-80°C（温度稳定性±1°C，容量500L）

13.生物安全柜：EscoAirstream（气流量0.4m/s，HEPA过滤等级）

14.显微成像系统：OlympusBX53（分辨率0.1μm，荧光通道5个）

15.服务器集群：DellPowerEdge（计算节点32核，存储100TB）

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。