心脏灌流心肌细胞circRNA功能检测
因您的需求、实验方案、检测样品、测试过程不同,相应的参考标准请咨询在线工程师!
文章概述:本文聚焦心脏灌流心肌细胞环状RNA(circRNA)功能检测技术,核心检测对象为心肌细胞在灌流条件下的circRNA表达、调控及功能机制。关键项目包括circRNA测序分析、功能验证实验(如敲除/过表达)、分子通路交互检测、细胞表型评估(如凋亡、代谢活性),以及电生理参数监测,确保全面评估circRNA在心肌疾病模型中的作用机制,涉及表达水平变化、信号通路调控和药物响应等指标。
检测项目
表达分析检测:
- circRNA测序:测序深度≥50Mreads(参照ENCODE标准),表达量差异倍数≥2倍
- qPCR验证:Ct值≤35(p<0.05),内参基因GAPDH稳定性要求SD≤0.5
- 微阵列杂交:探针特异性≥95%,检测限0.01fmol/µl
- 敲除/过表达实验:敲除效率≥80%(参照CRISPR-Cas9指南),过表达倍数≥5倍
- 功能挽救试验:表型恢复率≥70%,细胞存活率≥90%
- 荧光报告基因:荧光强度变化≥50%(p<0.01)
- RNA结合蛋白互作:结合亲和力Kd≤10nM(参照EMSA标准),互作位点验证率≥95%
- 信号通路分析:通路活性变化≥30%(p<0.05),磷酸化水平检测误差≤5%
- 甲基化状态:甲基化程度差异≥10%(BS-seq方法)
- 凋亡评估:凋亡率≤15%(AnnexinV/PI法),caspase活性变化≥2倍
- 代谢活性:ATP含量≥1.5nmol/mg蛋白(MTT法),耗氧率差异≥20%
- 增殖能力:增殖指数≥1.2(BrdU法),细胞周期G1/S期比例≥60%
- 动作电位:时程变化≥10ms(膜片钳技术),复极90%时间误差≤5ms
- 离子电流:钠电流密度≥100pA/pF(电压钳法),钙瞬变幅度≥20%
- 传导速度:≥0.5m/s(多电极阵列),异位搏动发生率≤5%
- 缺血再灌注损伤:损伤面积≤30%(TTC染色),circRNA表达变化≥3倍
- 心肌肥大:细胞面积增大≥20%(显微测量),ANP表达≥2倍
- 心律失常:室颤阈值≥10V(电刺激法),QT间期延长≥20ms
- 药效评估:IC50值≤10µM(剂量响应曲线),EC50误差≤10%
- 毒性测试:细胞毒性LD50≥100µM(CCK-8法),半数抑制浓度精确度±5%
- 协同作用:协同指数CI≤0.8(Chou-Talalay法)
- 糖酵解速率:乳酸产量≥2倍(Seahorse分析),氧消耗率变化≥15%
- 脂质代谢:甘油三酯含量≤0.5mg/mg蛋白(酶法),FFA水平差异≥25%
- 氧化应激:ROS水平≤1.5倍(DCFH-DA法),SOD活性≥80U/mg
- circRNA数据库比对:同源性≥90%(CircBase参考),预测准确率≥95%
- 网络互作建模:互作节点≥50(Cytoscape分析),富集分析p值≤0.01
- 变异检测:SNP检出率≥99%(GATK流程),插入缺失长度≤5bp
- 免疫组化:染色强度≥2+(DAB法),阳性细胞比例≥60%
- 原位杂交:信号噪声比≥5:1(探针特异性≥98%),定位准确率≥95%
- 超微结构:线粒体损伤评分≤2(TEM观察),肌节排列紊乱度≤10%
检测范围
1.大鼠原代心肌细胞:采用Langendorff灌流系统分离,检测重点为circRNA在缺血再灌注损伤中的表达调控及凋亡机制
2.小鼠心肌细胞系:如HL-1细胞,聚焦于circRNA在心肌肥大模型中的功能验证及信号通路交互
3.人心肌细胞系:如AC16细胞,检测重点为circRNA在心律失常模型中的电生理参数变化及药物响应
4.心肌组织切片:源自灌流心脏,检测重点为circRNA空间分布与组织病理学关联,包括纤维化区域表达差异
5.诱导多能干细胞来源心肌细胞:iPSC分化细胞,检测重点为circRNA在发育过程中的动态变化及疾病建模能力
6.心肌梗死模型组织:手术诱导样本,检测重点为circRNA在梗死边缘区的修复功能及代谢活性调控
7.心肌肥大细胞模型:血管紧张素II诱导,检测重点为circRNA表达与肥厚表型的相关性及分子机制
8.心律失常细胞模型:药物或基因修饰,检测重点为circRNA对离子通道功能的调节及传导速度影响
9.药物处理心肌细胞:如β受体阻滞剂暴露,检测重点为circRNA介导的药效动力学及毒性阈值
10.转基因动物心肌:circRNA过表达或敲除模型,检测重点为表型特异性及在心力衰竭中的功能验证
检测方法
国际标准:
- ISO20186-3:2021分子诊断中RNA测序方法(测序深度要求≥30Mreads)
- EN12687:2020细胞功能验证实验指南(敲除效率标准≥75%)
- NCBISRA标准:RNA-seq数据提交规范(数据质量控制Q30≥80%)
- GB/T37876-2019生物样本RNA提取方法(提取纯度A260/A280≥1.8)
- YY/T1573-2017心肌细胞电生理检测规程(动作电位记录精度±2ms)
- GB/T35823-2018细胞凋亡检测技术规范(AnnexinV阳性率误差≤5%)
检测设备
1.心脏灌流系统:Langendorff装置(流量范围1-10ml/min,温度控制±0.5°C)
2.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高6Tb/run,读取长度2×150bp)
3.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(检测通道6个,温度精度±0.1°C)
4.膜片钳系统:AxonMultiClamp700B(电流分辨率0.1pA,采样率100kHz)
5.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(激光波长488nm,检测速率25,000细胞/秒)
6.细胞培养箱:ThermoScientificHeracell150i(CO2控制±0.1%,湿度≥95%)
7.荧光显微镜:ZeissLSM880(分辨率0.2µm,共聚焦深度5µm)
8.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(RNA完整性数RIN≥8.0)
9.多功能酶标仪:TecanInfiniteM200(吸光度范围0-4OD,检测波长200-1000nm)
10.离心机:EppendorfCentrifuge5430R(转速范围100-30,000rpm,容量4×100ml)
11.超低温冰箱:ThermoScientificForma900系列(温度-80°C±5°C,容积900L)
12.电生理记录仪:MolecularDevicesAxonDigidata1550B(采样率1MHz,噪声<5µV)
13.Westernblot系统:Bio-RadTrans-BlotTurbo(转印时间≤7min,膜孔径0.2µm)
14.代谢分析仪:SeahorseXFe96(耗氧率检测精度±5%,通量96孔)
15.超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXPN-80(最大离心力802,000g,转子容量8×50ml)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。