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心脏灌流心肌细胞circRNA功能检测

因您的需求、实验方案、检测样品、测试过程不同,相应的参考标准请咨询在线工程师!

文章概述:本文聚焦心脏灌流心肌细胞环状RNA(circRNA)功能检测技术,核心检测对象为心肌细胞在灌流条件下的circRNA表达、调控及功能机制。关键项目包括circRNA测序分析、功能验证实验(如敲除/过表达)、分子通路交互检测、细胞表型评估(如凋亡、代谢活性),以及电生理参数监测,确保全面评估circRNA在心肌疾病模型中的作用机制,涉及表达水平变化、信号通路调控和药物响应等指标。

检测项目

表达分析检测:

  • circRNA测序:测序深度≥50Mreads(参照ENCODE标准),表达量差异倍数≥2倍
  • qPCR验证:Ct值≤35(p<0.05),内参基因GAPDH稳定性要求SD≤0.5
  • 微阵列杂交:探针特异性≥95%,检测限0.01fmol/µl
功能验证检测:
  • 敲除/过表达实验:敲除效率≥80%(参照CRISPR-Cas9指南),过表达倍数≥5倍
  • 功能挽救试验:表型恢复率≥70%,细胞存活率≥90%
  • 荧光报告基因:荧光强度变化≥50%(p<0.01)
分子机制检测:
  • RNA结合蛋白互作:结合亲和力Kd≤10nM(参照EMSA标准),互作位点验证率≥95%
  • 信号通路分析:通路活性变化≥30%(p<0.05),磷酸化水平检测误差≤5%
  • 甲基化状态:甲基化程度差异≥10%(BS-seq方法)
细胞表型检测:
  • 凋亡评估:凋亡率≤15%(AnnexinV/PI法),caspase活性变化≥2倍
  • 代谢活性:ATP含量≥1.5nmol/mg蛋白(MTT法),耗氧率差异≥20%
  • 增殖能力:增殖指数≥1.2(BrdU法),细胞周期G1/S期比例≥60%
电生理检测:
  • 动作电位:时程变化≥10ms(膜片钳技术),复极90%时间误差≤5ms
  • 离子电流:钠电流密度≥100pA/pF(电压钳法),钙瞬变幅度≥20%
  • 传导速度:≥0.5m/s(多电极阵列),异位搏动发生率≤5%
疾病模型检测:
  • 缺血再灌注损伤:损伤面积≤30%(TTC染色),circRNA表达变化≥3倍
  • 心肌肥大:细胞面积增大≥20%(显微测量),ANP表达≥2倍
  • 心律失常:室颤阈值≥10V(电刺激法),QT间期延长≥20ms
药物响应检测:
  • 药效评估:IC50值≤10µM(剂量响应曲线),EC50误差≤10%
  • 毒性测试:细胞毒性LD50≥100µM(CCK-8法),半数抑制浓度精确度±5%
  • 协同作用:协同指数CI≤0.8(Chou-Talalay法)
代谢检测:
  • 糖酵解速率:乳酸产量≥2倍(Seahorse分析),氧消耗率变化≥15%
  • 脂质代谢:甘油三酯含量≤0.5mg/mg蛋白(酶法),FFA水平差异≥25%
  • 氧化应激:ROS水平≤1.5倍(DCFH-DA法),SOD活性≥80U/mg
生物信息分析:
  • circRNA数据库比对:同源性≥90%(CircBase参考),预测准确率≥95%
  • 网络互作建模:互作节点≥50(Cytoscape分析),富集分析p值≤0.01
  • 变异检测:SNP检出率≥99%(GATK流程),插入缺失长度≤5bp
组织学检测:
  • 免疫组化:染色强度≥2+(DAB法),阳性细胞比例≥60%
  • 原位杂交:信号噪声比≥5:1(探针特异性≥98%),定位准确率≥95%
  • 超微结构:线粒体损伤评分≤2(TEM观察),肌节排列紊乱度≤10%

检测范围

1.大鼠原代心肌细胞:采用Langendorff灌流系统分离,检测重点为circRNA在缺血再灌注损伤中的表达调控及凋亡机制

2.小鼠心肌细胞系:如HL-1细胞,聚焦于circRNA在心肌肥大模型中的功能验证及信号通路交互

3.人心肌细胞系:如AC16细胞,检测重点为circRNA在心律失常模型中的电生理参数变化及药物响应

4.心肌组织切片:源自灌流心脏,检测重点为circRNA空间分布与组织病理学关联,包括纤维化区域表达差异

5.诱导多能干细胞来源心肌细胞:iPSC分化细胞,检测重点为circRNA在发育过程中的动态变化及疾病建模能力

6.心肌梗死模型组织:手术诱导样本,检测重点为circRNA在梗死边缘区的修复功能及代谢活性调控

7.心肌肥大细胞模型:血管紧张素II诱导,检测重点为circRNA表达与肥厚表型的相关性及分子机制

8.心律失常细胞模型:药物或基因修饰,检测重点为circRNA对离子通道功能的调节及传导速度影响

9.药物处理心肌细胞:如β受体阻滞剂暴露,检测重点为circRNA介导的药效动力学及毒性阈值

10.转基因动物心肌:circRNA过表达或敲除模型,检测重点为表型特异性及在心力衰竭中的功能验证

检测方法

国际标准:

  • ISO20186-3:2021分子诊断中RNA测序方法(测序深度要求≥30Mreads)
  • EN12687:2020细胞功能验证实验指南(敲除效率标准≥75%)
  • NCBISRA标准:RNA-seq数据提交规范(数据质量控制Q30≥80%)
国家标准:
  • GB/T37876-2019生物样本RNA提取方法(提取纯度A260/A280≥1.8)
  • YY/T1573-2017心肌细胞电生理检测规程(动作电位记录精度±2ms)
  • GB/T35823-2018细胞凋亡检测技术规范(AnnexinV阳性率误差≤5%)
国际标准侧重高通量测序和通用性,如ISO标准强调测序深度;国家标准注重具体操作参数,如GB/T标准规定RNA纯度指标更严格,但两者在功能验证实验均要求可重复性p<0.05。

检测设备

1.心脏灌流系统:Langendorff装置(流量范围1-10ml/min,温度控制±0.5°C)

2.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高6Tb/run,读取长度2×150bp)

3.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(检测通道6个,温度精度±0.1°C)

4.膜片钳系统:AxonMultiClamp700B(电流分辨率0.1pA,采样率100kHz)

5.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(激光波长488nm,检测速率25,000细胞/秒)

6.细胞培养箱:ThermoScientificHeracell150i(CO2控制±0.1%,湿度≥95%)

7.荧光显微镜:ZeissLSM880(分辨率0.2µm,共聚焦深度5µm)

8.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(RNA完整性数RIN≥8.0)

9.多功能酶标仪:TecanInfiniteM200(吸光度范围0-4OD,检测波长200-1000nm)

10.离心机:EppendorfCentrifuge5430R(转速范围100-30,000rpm,容量4×100ml)

11.超低温冰箱:ThermoScientificForma900系列(温度-80°C±5°C,容积900L)

12.电生理记录仪:MolecularDevicesAxonDigidata1550B(采样率1MHz,噪声<5µV)

13.Westernblot系统:Bio-RadTrans-BlotTurbo(转印时间≤7min,膜孔径0.2µm)

14.代谢分析仪:SeahorseXFe96(耗氧率检测精度±5%,通量96孔)

15.超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXPN-80(最大离心力802,000g,转子容量8×50ml)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

心脏灌流心肌细胞circRNA功能检测
中析研究所

北京中科光析科学技术研究所(简称中析研究所),隶属于北京前沿科学技术研究院,为集体所有制单位,是以科研检测为主的科学技术研究机构。中析研究所坚持基础研究与应用研究并重、应用研究和技术转化相结合,发展为以“任务带学科”为主要特色的综合性研究所。经国家有关部门批准,成为第三方分析测试技术服务单位,旗下实验室机构获得CMA资质认证。开展了研发设计、分析检测、试验验证、共性加工、信息及知识产权等服务,为科技型企业创新提供公共服务。本所得到政府创新基金的支持,被评为国家高新技术企业。

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