甲基化检测
检测项目
基因组甲基化水平:
- 全基因组甲基化密度:平均甲基化频率(0%-100%)、CpG位点覆盖率(≥95%,参照ENCODE标准)
- 5-甲基胞嘧啶含量:绝对定量(ppm,精度±0.5ppm)
基因特异性甲基化:
- 启动子区域甲基化:甲基化状态(二元值:甲基化/未甲基化)、甲基化比率阈值(≥20%为阳性)
- 抑癌基因甲基化检测:特定基因位点(如p16、BRCA1)甲基化密度(百分比±2%)
CpG岛甲基化分析:
- CpG岛覆盖率:岛内位点检测比例(≥90%,参照UCSC数据库)
- 甲基化异质性指数:变异系数(CV≤15%)
非编码RNA甲基化:
- miRNA甲基化水平:甲基化位点数量(整数计数)、相对甲基化率(0-1范围)
- lncRNA甲基化状态:位点特异性甲基化(二元判定)
组蛋白甲基化检测:
- H3K27me3修饰水平:相对丰度(百分比,精度±1%)
- H3K4me3比率:峰值覆盖度(≥80%)
疾病标志物甲基化:
- 癌症相关甲基化:甲基化生物标志物(如SEPT9)灵敏度(≥95%)
- 神经退行性甲基化模式:位点甲基化频率(0-100%)
环境暴露甲基化:
- 吸烟相关甲基化位点:甲基化变化率(|Δ|≥5%)
- 污染物响应甲基化:累积甲基化指数(CI值)
年龄相关甲基化:
- DNA甲基化时钟:表观遗传年龄(年,偏差±2年)
- 衰老相关位点甲基化:甲基化衰退率(%/年)
甲基化定量分析:
- 甲基化比率计算:β值(0-1范围,精度0.01)
- 差异甲基化区域:显著性p值(p≤0.05)
甲基化阵列检测:
- 450K/850K阵列覆盖:位点检测数(≥850,000个)、信号强度(≥10,000单位)
- 甲基化特异性探针:杂交效率(≥98%)
检测范围
1.血液样本:外周血单核细胞DNA,重点检测全基因组甲基化图谱和循环肿瘤DNA甲基化标志物
2.组织样本:福尔马林固定石蜡包埋组织,侧重启动子甲基化状态分析和组织特异性修饰
3.细胞培养物:体外培养细胞系,核心检测培养条件影响的甲基化动态变化和稳定性
4.唾液样本:非侵入性采集样本,重点分析口腔疾病相关基因位点甲基化和微生物甲基化
5.尿液样本:泌尿系统样本,侧重膀胱癌甲基化生物标志物检测和细胞游离DNA甲基化
6.脑脊液样本:中枢神经系统样本,核心检测神经退行性疾病甲基化模式如阿尔茨海默病标志物
7.植物样本:作物叶片或种子DNA,重点评估环境胁迫响应甲基化和育种相关修饰
8.微生物样本:细菌或病毒DNA,侧重病原体甲基化特征和抗生素抗性基因甲基化
9.法医学样本:微量DNA样本如头发或皮肤,核心检测身份鉴定甲基化标记和降解样本恢复
10.药物研发样本:体外或体内模型,重点分析药效甲基化生物标志物和表观遗传药物响应
检测方法
国际标准:
- ISO20395:2019生物技术-DNA甲基化测序方法
- ENISO21571:2005食品-DNA提取和甲基化分析
- ISO17025:2017检测实验室通用要求(涵盖甲基化验证)
- 差异说明:ISO标准强调高通量测序数据标准化,而ENISO侧重样本前处理一致性
国家标准:
- GB/T30988-2014多酚氧化酶活性测定方法(扩展至甲基化检测)
- GB/T37837-2019生物样本DNA甲基化检测规程
- GB/T34801-2017分子诊断试剂盒通用技术要求(适用于甲基化试剂)
- 差异说明:GB标准优先亚硫酸氢盐PCR方法,与国际ISO的测序主导方法在灵敏度上差异±5%
检测设备
1.高通量测序仪:Novaseq6000型(通量20TB/run,读长2×150bp)
2.甲基化特异性PCR仪:QuantStudio7型(温度精度±0.1℃,通道数6)
3.液相色谱质谱联用仪:6495C型(质量范围50-2000m/z,检测限0.1pg)
4.甲基化阵列扫描仪:iScan型(分辨率5μm,扫描速度10秒/样本)
5.紫外分光光度计:NanoDropOne型(波长范围190-840nm,精度0.1A)
6.荧光定量PCR系统:CFX96型(动态范围10^9,精度±0.5%)
7.核酸提取工作站:KingFisherFlex型(通量96样本/批,回收率≥95%)
8.电泳成像系统:GelDocXR+型(像素500万,灵敏度0.1ngDNA)
9.生物分析仪:2100型(核酸片段大小分析,范围25-12000bp)
10.恒温混匀仪:ThermomixerC型(温度范围-10°C至100°C,振荡速度3000rpm)
11.超低温冰箱:UxF系列(温度-86°C,容量700L)
12.离心机:Centrifuge5424型(转速15000rpm,容量24×1.5mL)
13.生物安全柜:ClassIIA2型(气流速度0.45m/s,HEPA过滤)
14.微孔板阅读器:SpectraMaxi3x型(波长范围230-1000nm,孔数384)
15.真空浓缩仪:SpeedVacSPD120型(真空度<1mbar,温度控制40°C)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。