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沉降菌16SrRNA基因测序分析

检测项目

样品采集:

  • 沉降时间:标准24小时(参照ISO14698-1)
  • 采样位置:高度1.5米,无干扰源
DNA提取:
  • DNA浓度:≥10ng/μL
  • DNA纯度:OD260/280比值1.8-2.0
PCR扩增:
  • 扩增效率:循环数25-35
  • 引物特异性:V3-V4区域(参照Illumina指南)
文库构建:
  • 文库浓度:≥2nM
  • 片段大小:300-600bp
高通量测序:
  • 测序深度:≥50,000reads/sample
  • 读长:2×250bp(参照MiSeq标准)
质量控制:
  • Q30值:≥80%
  • 嵌合体率:≤1%
OTU聚类:
  • 相似度阈值:97%
  • OTU数量:反映多样性
分类学分析:
  • 数据库匹配:Greengenes或SILVA
  • 置信度:≥0.7
多样性指数:
  • Shannon指数:计算微生物丰富度
  • Simpson指数:评估群落均匀度
病原菌检测:
  • 特定病原菌:如金黄色葡萄球菌,检出限10^3CFU

检测范围

1.室内空气沉降菌:涵盖住宅及办公室环境,重点检测总菌落数和常见细菌多样性

2.医院环境沉降菌:包括病房及手术室,重点检测耐药菌和病原菌如MRSA

3.食品加工环境沉降菌:涉及生产线及储藏区,重点检测卫生指标菌如大肠杆菌

4.洁净室沉降菌:针对制药及电子行业,重点检测微生物污染控制水平

5.学校教室沉降菌:包含幼儿园至高校,重点检测儿童暴露风险及空气质量影响

6.公共交通沉降菌:如地铁及巴士站,重点检测高密度人群传播的微生物群落

7.农业环境沉降菌:覆盖农田及温室,重点检测土壤来源细菌及肥料影响

8.水体相关沉降菌:包括湖泊及河流周边,重点检测水生病原菌如军团菌

9.工业环境沉降菌:如化工厂及车间,重点检测特定污染物如重金属耐受菌

10.实验室沉降菌:涵盖生物安全柜及工作台,重点检测交叉污染风险

检测方法

国际标准:

  • ISO14698-1:2003生物污染控制-空气微生物采样方法
  • ISO17601:2016土壤质量-DNA提取及纯化方法
  • ISO20279:2015分子生物学检测-PCR扩增指南
国家标准:
  • GB/T18883-2002室内空气质量标准-微生物检测部分
  • GB/T5750.12-2006生活饮用水标准检验方法-微生物指标
  • GB/T35811-2018生物样品DNA提取技术规范
(方法差异说明:ISO沉降采样使用标准沉降板,GB补充多点采样;DNA提取中ISO强调缓冲液成分,GB注重提取效率验证;PCR扩增ISO规定循环参数,GB优化引物设计)

检测设备

1.沉降采样器:标准沉降板(直径90mm)

2.DNA提取仪:通用提取试剂盒(提取效率>90%)

3.PCR仪:96孔热循环仪(温度均匀性±0.2°C)

4.电泳仪:琼脂糖凝胶系统(电压范围50-300V)

5.荧光定量PCR仪:实时定量系统(检测限1copy)

6.高通量测序仪:基因测序平台(通量25Mreads)

7.文库制备仪:自动化工作站(精度±1%)

8.离心机:高速离心设备(转速14,000rpm)

9.分光光度计:紫外分光仪(波长260/280nm)

10.生物信息学服务器:高性能计算系统(内存256GB,CPU32核)

11.恒温培养箱:温度控制设备(范围20-60°C)

12.超净工作台:无菌操作台(风速0.45m/s)

13.冷冻存储:超低温冰箱(温度-80°C)

14.显微镜:光学显微系统(放大40-1000x)

15.数据分析软件:生物信息学工具(版本2023.2)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

沉降菌16SrRNA基因测序分析
其他检测

中析研究所可进行各种检测分析服务,包括不限于:标准试验,非标检测,分析测试,认证设计,产品验收,质量内控,矢量分析,内部控制,司法鉴定等。可出具合法合规、具有公信力的第三方检测报告。