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药物代谢酶基因多态性检测

因您的需求、实验方案、检测样品、测试过程不同,相应的参考标准请咨询在线工程师!

文章概述:药物代谢酶基因多态性检测通过高通量分子生物学技术分析个体基因组中关键药物代谢酶基因的遗传变异,核心检测对象包括CYP450超家族(如CYP2D6、CYP2C19、CYP3A4)、UGT酶及TPMT等基因的多态性位点。关键项目涵盖单核苷酸多态性(SNP)检测、拷贝数变异分析、插入/缺失突变识别及代谢表型预测,参照PharmVar数据库和CPIC临床指南评估等位基因频率与药物代谢活性关联性,为精准用药提供遗传学依据。

检测项目

代谢酶基因分型:

  • CYP2D6检测:*3、*4、*5等变异等位基因频率(检测阈值≥1%,参照CPIC指南)
  • CYP2C19检测:*2、3、17等突变位点检出率(灵敏度≥99.9%)
  • CYP3A4检测:22、1B等SNP识别(等位基因分型准确性≥98%)
UGT酶变异分析:
  • UGT1A128检测:TA重复序列长度分析(重复数≥7)
  • UGT2B7检测:-161C>T等SNP位点(变异检出限:0.1%)
TPMT多态性检测:
  • TPMT2、3A、3C变异:活性降低预测(参考值≤30%活性)
  • TPMT1野生型识别:正常代谢表型确认(等位基因频率标准)
DPYD基因检测:
  • DPYD2A突变:预测5-FU毒性风险(特异度≥95%)
  • DPYD13变异:酶活性缺失分析(检出精度±0.5%)
拷贝数变异评估:
  • CYP2D6拷贝数:正常范围检测(2拷贝,变异阈值±1)
  • CYP2A6缺失/重复:基因剂量效应分析(灵敏度≥99%)
插入/缺失突变检测:
  • CYP2D6基因缺失(Del):片段缺失识别(最小检测尺寸:50bp)
  • CYP2C1917插入:序列插入分析(准确度≥98.5%)
代谢表型预测:
  • 弱代谢者(PM)预测:基于基因型组合(PM概率≥80%)
  • 超快代谢者(UM)预测:等位基因活性评分(评分范围0-3)
等位基因打分系统:
  • 代谢活性评分:数值范围0-3(阈值判定:PM≤0.5)
  • 表型分类:中间代谢者(IM)预测(评分1.0-2.0)
药物代谢路径分析:
  • 主代谢酶识别:如CYP3A4主导路径(参与度≥70%)
  • 次要路径评估:UGT酶贡献率计算(变异影响因子)
临床相关性评估:
  • 药物剂量建议:依据CPIC指南调整(剂量偏差±20%)
  • 不良反应风险:比值比(OR)计算(OR≥2.0高风险)

检测范围

1.外周血样本:EDTA抗凝全血,重点检测白细胞DNA提取纯度(A260/A280比值1.8-2.0)

2.唾液样本:Oragene采集管收集,侧重DNA浓度检测(≥50ng/μL)及稳定性分析

3.口腔拭子样本:FTA卡保存,核心检测DNA完整性(片段大小≥200bp)

4.组织活检样本:福尔马林固定石蜡包埋组织,重点评估DNA片段化程度(降解率≤10%)

5.细胞培养物:永生细胞系,检测基因表达与代谢酶活性相关性(变异系数≤5%)

6.新生儿筛查样本:滤纸血斑,侧重微量DNA检测(最低检出量:10ng)

7.法医学样本:陈旧或降解样本,重点处理DNA修复与变异识别准确性(误差率≤1%)

8.临床试验样本:匿名化处理样本,核心评估批内一致性(相关系数≥0.95)

9.药物反应研究样本:暴露前后采集,侧重代谢酶动态变化分析(变异频率监测)

10.群体遗传学研究样本:大规模队列样本,重点检测基因频率分布(群体偏差校正)


检测方法

国际标准:

  • FDAGuidanceforPharmacogenomicDataSubmissions:药物基因组学数据提交规范
  • EMAGuidelineonPharmacogenomicsinPharmacovigilance:药物警戒中基因组学应用指南
  • ISO15189:2022Medicallaboratories:医学实验室质量要求
  • CLSIMM01-A2:分子诊断方法验证标准
国家标准:
  • 中国药典2020年版四部:基因检测技术要求
  • GB/T29803-2013:基因多态性检测通用规范
  • GB/T30999-2014:生物样本库质量标准
  • YY/T1454-2016:分子诊断试剂盒性能评估
方法差异说明:国际标准如FDA强调临床验证与数据报告,国家标准如中国药典侧重实验室操作规范与质量控制;PCR与NGS方法差异:PCR适用于靶向SNP检测(耗时短),NGS适用于全基因扫描(通量高但数据分析复杂);等位基因频率计算中,国际标准采用PharmVar数据库,国家标准参照本土群体数据校准。

检测设备

1.实时荧光定量PCR仪:ABI7500型(检测通道:6通道,灵敏度:0.1拷贝/μL)

2.高通量测序平台:IlluminaNovaSeq6000(通量:20Tb/run,读长:2x150bp)

3.DNA提取仪:QIAcubeHT型号(提取效率:≥95%,样本处理量:96孔)

4.微阵列扫描仪:AffymetrixGeneChipScanner3000(分辨率:5μm,动态范围:10^4)

5.毛细管电泳仪:ABI3500xLGeneticAnalyzer(片段大小检测范围:50-1000bp,精度:±1bp)

6.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(DNA完整性评分:DV200≥30%)

7.紫外分光光度计:NanoDropOne(核酸浓度检测范围:2-15000ng/μL,精度:±5%)

8.PCR扩增仪:Veriti96孔型号(温度均一性:±0.1°C,升降温速率:4°C/s)

9.离心机:EppendorfCentrifuge5424R(转速范围:200-14000rpm,容量:24x1.5mL)

10.恒温混匀器:ThermoMixerC(温度范围:10-99°C,振荡频率:300-1400rpm)

11.液氮存储系统:气相液氮罐(存储温度:-196°C,样本容量:5000支)

12.超净工作台:生物安全柜级别Ⅱ(洁净度:ISO5级,气流速率:0.4m/s)

13.冷藏冰箱:4°C存储单元(温度稳定性:±2°C,容积:500L)

14.冷冻冰箱:-80°C超低温冰箱(温度波动:≤±5°C,能耗:≤1.5kW)

15.数据分析工作站:高性能计算系统(处理器:IntelXeon,RAM:256GB,存储:10TB)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

药物代谢酶基因多态性检测
中析研究所

北京中科光析科学技术研究所(简称中析研究所),隶属于北京前沿科学技术研究院,为集体所有制单位,是以科研检测为主的科学技术研究机构。中析研究所坚持基础研究与应用研究并重、应用研究和技术转化相结合,发展为以“任务带学科”为主要特色的综合性研究所。经国家有关部门批准,成为第三方分析测试技术服务单位,旗下实验室机构获得CMA资质认证。开展了研发设计、分析检测、试验验证、共性加工、信息及知识产权等服务,为科技型企业创新提供公共服务。本所得到政府创新基金的支持,被评为国家高新技术企业。

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