质粒保真度分析
检测项目
完整性检测:
- 凝胶电泳分析:片段大小(bp范围)、迁移率(参照ISO17025)
- 毛细管电泳分析:峰面积比例(≥95%)、分辨率(0.1bp)
- 脉冲场电泳分析:大片段完整性(≥90%)
- Sanger测序:覆盖率(≥98%)、错误率(≤0.1%)
- NGS测序:深度(≥50×)、变异检测(灵敏度≥99%)
- 杂交分析:序列匹配率(≥99.5%)
- 吸光度检测:A260/A280比值(1.8-2.0)、A260/A230比值(≥2.0)
- 凝胶纯化分析:杂质残留(≤5%)
- 色谱分析:核酸纯度(≥95%)
- qPCR测定:拷贝数(偏差±5%)、标准曲线R²(≥0.99)
- 荧光定量分析:相对拷贝数(精度±2%)
- 数字PCR验证:绝对拷贝数(误差≤1%)
- 酶切效率:片段释放率(≥95%)
- 酶特异性:非特异性切割(≤1%)
- 缓冲优化:最佳pH(7.0-7.5)
- 扩增特异性:目标条带强度(≥90%)、非特异性扩增(≤5%)
- 循环阈值:Ct值(变异系数≤2%)
- 产物大小:长度一致性(±5bp)
- 序列比对:一致性(≥99.9%)、缺口率(≤0.01%)
- 变异调用:SNP检测(灵敏度≥98%)
- 组装验证:覆盖完整性(≥99%)
- 加速降解:降解率(≤5%/月)、温度敏感性(-80°C存储)
- 反复冻融:完整性损失(≤3%)
- 长期保存:保质期验证(≥2年)
- 转染效率:表达水平(≥90%)、细胞存活率(≥95%)
- 蛋白产量:表达量(mg/L范围)、可溶性(≥80%)
- 报告基因检测:荧光强度(RFU≥1000)
- 宿主残留:DNA含量(≤1ng/μg)、RNA污染(≤0.5%)
- 内毒素检测:水平(≤0.1EU/μg)
- 微生物筛查:无菌性(参照ISO11737)
检测范围
1.克隆质粒:用于基因克隆插入,重点检测插入序列准确性和酶切位点完整性
2.表达载体:涉及蛋白表达系统,侧重启动子功能验证和表达效率分析
3.病毒载体质粒:应用于基因治疗,核心检测病毒包装效率和生物安全评估
4.合成质粒:人工合成DNA载体,重点验证序列准确性和合成杂质残留
5.报告质粒:含荧光或酶报告基因,侧重信号强度和背景干扰检测
6.穿梭质粒:跨宿主系统使用,核心评估宿主兼容性和复制稳定性
7.高拷贝质粒:高复制数载体,重点检测拷贝数一致性和降解风险
8.低拷贝质粒:稳定表达系统,侧重长期保存完整性和功能维持
9.突变库质粒:用于突变研究,核心验证突变频率和序列变异
10.疫苗质粒:DNA疫苗应用,重点筛查内毒素和免疫原性测试
检测方法
国际标准:
- ISO20395:2019生物技术-DNA测序方法(序列准确性验证)
- ISO17025:2017测试实验室能力要求(完整性分析)
- ISO11737-1:2018灭菌产品微生物检测(污染筛查)
- GB/T37871-2019质粒DNA纯度检测方法(吸光度标准)
- GB/T34796-2017分子生物学PCR检测(扩增验证)
- GB/T35823-2018生物样本稳定性评估(降解测试)
检测设备
1.凝胶电泳系统:Bio-RadPowerPacBasic(电压范围5-300V,分辨率0.1bp)
2.毛细管电泳仪:Agilent2100Bioanalyzer(芯片灵敏度达0.1ng/μl)
3.DNA测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高6Tb/run,错误率≤0.1%)
4.紫外分光光度计:ThermoNanoDropOne(波长范围190-840nm,精度±0.003)
5.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(动态范围10¹-10⁹拷贝,温控精度±0.1°C)
6.数字PCR系统:Bio-RadQX200(分区数20,000,检测限≤1拷贝/μl)
7.酶标仪:TecanInfiniteM200(波长范围230-1000nm,灵敏度0.001OD)
8.生物反应器:SartoriusBIOSTAT(培养体积1-10L,pH控制±0.05)
9.显微镜系统:OlympusIX83(放大倍数1000×,成像分辨率0.2μm)
10.离心机:EppendorfCentrifuge5424(转速范围300-15,000rpm,温控±1°C)
11.冻干机:LabconcoFreeZone(真空度≤100mTorr,温度范围-50°C至40°C)
12.超低温冰箱:ThermoScientificForma(温度-86°C,稳定性±2°C)
13.纯化工作站:QiagenQIAcube(通量96样本/小时,回收率≥95%)
14.光谱分析仪:PerkinElmerLambda950(波长精度±0.08nm,扫描速度2400nm/min)
15.细胞培养箱:MemmertINCO(CO₂控制±0.1%,湿度范围70-95%)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。