心脏灌流心肌细胞非编码RNA表达分析
检测项目
RNA表达分析:
- lncRNA表达量:差异倍数(|log2FC|≥1,参照ENCODE标准)
- miRNA表达量:拷贝数变化(变异系数≤10%,参照miRBase)
- circRNA丰度:RPKM值(范围0.1-100)
- 存活率检测:MTT吸光度(OD值≥0.8)
- 凋亡率分析:AnnexinV阳性率(百分比,参照流式细胞术标准)
- TNF-α浓度:pg/mL(检测限0.1pg/mL)
- IL-6表达:相对定量(倍数变化≥2)
- MDA含量:nmol/mg蛋白(标准曲线R²≥0.99)
- SOD活性:U/mg蛋白(参照ISO21427)
- qRT-PCR验证:Ct值(内参基因GAPDH,ΔΔCt法)
- WesternBlot:蛋白表达量(灰度值分析)
- PI3K/AKT通路:磷酸化水平(相对强度≥1.5)
- MAPK激活:ERK1/2磷酸化率(百分比)
- ATP含量:μmol/g组织(检测精度±5%)
- 乳酸水平:mmol/L(参照临床生化标准)
- 细胞形态评分:损伤指数(0-4级)
- 超微结构:线粒体完整性(电镜评级)
- 收缩力测量:峰值力(mN,参照离体灌流系统)
- 钙瞬变:荧光强度(F/F0比值)
- 差异表达基因:P值(≤0.05)
- 通路富集:KEGG富集分数(≥2)
检测范围
1.人源心肌细胞样本:涵盖原代培养细胞,检测重点为缺血再灌注后非编码RNA表达变化及细胞凋亡关联。
2.鼠源心肌细胞样本:包括C57BL/6等品系,侧重灌流模型中lncRNA和miRNA的时序表达分析。
3.猪源心肌细胞样本:用于大型动物模型,重点检测氧化应激指标与RNA表达相关性。
4.体外培养心肌细胞系:如H9c2细胞,检测药物干预下非编码RNA表达差异及活力影响。
5.缺血再灌注模型组织:涵盖离体心脏灌流标本,检测重点为再灌注损伤相关的circRNA丰度变化。
6.药物处理样本:包括抗缺血药物暴露细胞,侧重信号通路激活与RNA表达调控。
7.基因编辑细胞:如CRISPR修饰样本,检测特定非编码RNA敲除后的功能表型及表达恢复。
8.临床患者心肌活检:来自冠心病患者,重点分析miRNA表达谱与临床病理参数关联。
9.动物模型心肌组织:如心梗模型,检测灌流后炎症因子与lncRNA共表达网络。
10.细胞共培养系统:心肌细胞与内皮细胞共培养,侧重细胞间通讯相关的非编码RNA表达。
检测方法
国际标准:
- ISO20184-1:2020高通量RNA测序方法(采用Illumina平台)
- ENISO10993-5:2020细胞活力检测(MTT法)
- ISO21427:2006氧化应激生物标志物分析(SOD活性测定)
- ISO15197:2013炎症因子ELISA检测(灵敏度要求0.1pg/mL)
- GB/T37868-2019RNA提取与纯化(柱离心法)
- GB/T16886.5-2017细胞凋亡检测(流式细胞术)
- GB/T5009.124-2016代谢产物测定(ATP生物发光法)
- GB/T30987-2020基因表达qRT-PCR验证(ΔΔCt计算)
检测设备
1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Breads/run,错误率≤0.1%)
2.实时荧光定量PCR仪:AppliedBiosystemsQuantStudio7(动态范围10^8,精度±0.2Ct)
3.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(检测通道18个,流速12μL/min)
4.酶标仪:BioTekSynergyH1(波长范围200-999nm,分辨率1nm)
5.超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXPN-100(最大转速100,000rpm,温控±0.5°C)
6.电化学发光检测仪:MesoScaleDiscoveryS600(灵敏度0.01pg/mL,多因子同步)
7.倒置显微镜:OlympusIX83(放大倍数1000X,CCD分辨率5MP)
8.透射电镜:JEOLJEM-1400Plus(分辨率0.2nm,加速电压120kV)
9.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(RNA完整性数RIN≥8.0)
10.离体灌流系统:ADInstrumentsLangendorff(灌流压80mmHg,流速10mL/min)
11.蛋白印迹系统:Bio-RadChemiDocMP(检测限0.1ng,线性范围6logs)
12.微孔板处理器:HamiltonMicrolabSTAR(加样精度±1μL,通量96孔)
13.低温存储箱:ThermoScientificForma-86°C(温度稳定性±1°C,容量800L)
14.生物安全柜:EscoAirstreamClassII(风速0.5m/s,HEPA过滤)
15.荧光显微镜:NikonEclipseTi2(激发波长400-700nm,共聚焦模块)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
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非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。